183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3861 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  89.34 
 
 		 136 aa  233  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  89.34 
 
 		 136 aa  233  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  76.34 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  82.11 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  76.42 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  68.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  56.78 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  60 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  57.98 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  54.1 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  43.08 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  33.61 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  33.04 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  36.61 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  33.04 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  33.04 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  33.04 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.35 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 403 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2578  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 446 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1421  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512888  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1280  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 446 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 446 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  25 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1914  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 815 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.979442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 221 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  32.06 
 
 		 221 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1394  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 450 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.205793  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2299  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 446 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  25.4 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3230  flagellar regulatory protein C  27.42 
 
 		 446 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  27.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 446 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  27.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  30.53 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  26.79 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  26.09 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  32.14 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3273  two component Fis family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 225 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 484 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>