296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0033 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  100 
 
 		 153 aa  313  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  80 
 
 		 136 aa  215  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  80 
 
 		 136 aa  215  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  82.11 
 
 		 131 aa  209  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  75.61 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  76.47 
 
 		 131 aa  193  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  71.54 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  64.18 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  65 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  56.39 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  58.12 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  55.22 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  58.26 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  38.28 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  41.44 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  38.05 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  36.97 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  29.71 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  29.71 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  31.9 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  31.03 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  31.03 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  31.03 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 		 737 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 403 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  30 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  32.26 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 450 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.594792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0018  two component Fis family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.594546  normal  0.0172011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  27.66 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  28.89 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 447 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 447 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 508 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 510 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 447 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05158  transcriptional regulatory protein CpxR  29.84 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.65 
 
 		 447 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2299  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 446 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1037 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  30.48 
 
 		 225 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2578  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 446 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 466 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.634231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  29.46 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.71 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.63 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  30.89 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1663  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>