158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3508 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  98.53 
 
 		 136 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  89.34 
 
 		 131 aa  233  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  80 
 
 		 153 aa  214  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  80.33 
 
 		 131 aa  206  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  73.48 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  78.15 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  65.65 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  65.19 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  60.61 
 
 		 136 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  57.38 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  56.69 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  50.36 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  43.09 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  40.31 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  35.65 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  36.04 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 143 aa  57  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  32 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  28.46 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  30.63 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 403 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  30.63 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  30.63 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  25.66 
 
 		 272 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1421  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512888  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  30.6 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  25.23 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  27.83 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2299  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 446 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  28.68 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.48 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.35 
 
 		 220 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  29.09 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  27.5 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  28.68 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  27.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  27.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  27.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 508 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  27.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  31.25 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  29.7 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  27.93 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>