More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1245 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  100 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  92.65 
 
 		 136 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  92.65 
 
 		 136 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  91.91 
 
 		 136 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  60 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  55.22 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  55.15 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  55.15 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  55.15 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  59.69 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.25 
 
 		 403 aa  120  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  49.65 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  35.9 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  32.28 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  30.95 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  33.63 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.78 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  30 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  30.71 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  30.71 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  34.43 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.74 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  30.77 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  29.17 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  37.3 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  31.47 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  32.62 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4442  response regulator receiver domain-containing protein  31.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.61 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  29.92 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  30 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  29.51 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.52 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  43.37 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  30.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.13 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  31.2 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 220 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  32.38 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  27.64 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>