33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4452 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  49.23 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1148  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  40 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  35.34 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  34.48 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  34.48 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  34.48 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  29.73 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  28.44 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  25.74 
 
 		 155 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  24.39 
 
 		 156 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  24.56 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  24.56 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>