More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1849 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  78.03 
 
 		 403 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  50.38 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  49.65 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  50.38 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  50.38 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  48.18 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  35 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  32.84 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  33.05 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  27.13 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  27.13 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  34.51 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.23 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  28.97 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.42 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  30.25 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2436  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  30.77 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.15 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  32.17 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  30 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  29.46 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0013  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.52 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.349161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  24.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  24.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  24.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  24.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  24.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>