293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0882 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  88.52 
 
 		 132 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  76.34 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  75.57 
 
 		 136 aa  206  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  80.33 
 
 		 136 aa  206  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  76.47 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  72.95 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 136 aa  170  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  64.71 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  58.59 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  58.47 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  35.88 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  32.52 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  40.45 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  31.53 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  31.53 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  32.43 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  32.43 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  32.43 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 		 737 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 403 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  33.63 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.19 
 
 		 242 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  27.97 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  27.97 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  30.97 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  26.27 
 
 		 230 aa  48.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.12 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  27.12 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 466 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.634231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  25.44 
 
 		 223 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  31.4 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 262 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.35 
 
 		 464 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 359 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  29.09 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3601  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 450 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.594792  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  28 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32 
 
 		 463 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  32.46 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  28.7 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 1002 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 478 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  25.41 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 556 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.72 
 
 		 447 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  24.21 
 
 		 237 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 447 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 457 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.91 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 447 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>