More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5812 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  54.48 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  55.8 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  55.8 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  55.8 
 
 		 136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  55.28 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  55.15 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  53.73 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  53.44 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.82 
 
 		 403 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  48.82 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  39.62 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  31.62 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  36.76 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  28.89 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  33.64 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  30.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  30.4 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  33.66 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  31.37 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.77 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  30.36 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  27.73 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.96 
 
 		 353 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  29.31 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.04 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.71 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  33.66 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  33.07 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 223 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.51 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  33.66 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  34.91 
 
 		 220 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  29.37 
 
 		 306 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.8 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>