More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4442 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4442  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  84.3 
 
 		 172 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  71.64 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.9 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  70.15 
 
 		 228 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  72.44 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  71.88 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3423  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.15 
 
 		 235 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.7 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.26 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 220 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 223 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4860  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.142587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4712  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.57 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4343  response regulator receiver  43.57 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 224 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 224 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 215 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.66 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 226 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  34.39 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 215 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 215 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 215 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  36.72 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  43.31 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 213 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 218 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 213 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  41.3 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 214 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.94 
 
 		 214 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 215 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 214 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  33.12 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  34.38 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  33.12 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 303 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  31.21 
 
 		 214 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  35.61 
 
 		 223 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 224 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 220 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  30.59 
 
 		 214 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 220 aa  98.6  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 222 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>