66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0108 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  65.43 
 
 
322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  63.75 
 
 
327 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  43.4 
 
 
328 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  47.56 
 
 
325 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  42.09 
 
 
331 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  39.33 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  41.23 
 
 
336 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  38.23 
 
 
308 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  36.39 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  34.63 
 
 
324 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  32.06 
 
 
310 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  34.04 
 
 
303 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  30.57 
 
 
314 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  32.27 
 
 
295 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  31.4 
 
 
307 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  32.34 
 
 
310 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  29.81 
 
 
318 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  30.39 
 
 
303 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  34.62 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  30.72 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  29.89 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  29.33 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  29.77 
 
 
303 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  27.6 
 
 
343 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.13 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  27.53 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  29.02 
 
 
304 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  28.17 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  26.63 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.93 
 
 
348 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  29.31 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  26.07 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  26.76 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  27.33 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.84 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  25.93 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  26.44 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.82 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  34.44 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  30.84 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  24.52 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  32.22 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  29.29 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.23 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.3 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  26.05 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  24.77 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.85 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.36 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.61 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.41 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  26.37 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  28.76 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  31.39 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  31.35 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.89 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.92 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  25.81 
 
 
1588 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  25.81 
 
 
342 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  23.96 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  23.91 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>