42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00770 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  56.63 
 
 
329 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  31.69 
 
 
316 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  31.4 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  27.19 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.07 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  25.8 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  28.8 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  28.4 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  24.61 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  31.89 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26.15 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.15 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.43 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  25.47 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  31.74 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  30.73 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.14 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  22.79 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.3 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.24 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  23.93 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  23.05 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.62 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  23.84 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.4 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  25.59 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  24.39 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23.86 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26.16 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  23.9 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  27.17 
 
 
1588 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.8 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  22.73 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.56 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  28.3 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  23.94 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  28.33 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  23.56 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  27.11 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>