56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3583 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  42.09 
 
 
309 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  34.11 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  31.05 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  32.57 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  33.74 
 
 
323 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  28.27 
 
 
303 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.67 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  27.62 
 
 
295 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.75 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  27.84 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  28.43 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  29.7 
 
 
336 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26 
 
 
310 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  29.33 
 
 
331 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  29.02 
 
 
303 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  28.29 
 
 
327 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.44 
 
 
318 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  28.46 
 
 
310 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.9 
 
 
332 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  26.95 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.81 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.53 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.52 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.98 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.98 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  23.1 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.84 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  24.15 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  23.8 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.36 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.83 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.54 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  23.21 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  33.1 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.6 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  36.04 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  35.51 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  25.21 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  27.54 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.48 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  32.58 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.71 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.44 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  21.18 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  30.16 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.12 
 
 
346 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  32.74 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  23.6 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  27.27 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  28.36 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  29.27 
 
 
342 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>