60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1742 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  67.7 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  43.64 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  37.08 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  33.72 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  33.43 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  34.74 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  31.63 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  28.92 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  27.66 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  28.37 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.72 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  27.95 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  29.27 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  27.69 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  26.96 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  26.89 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  27.93 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  29.33 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  27.84 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.29 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  27.71 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  26.33 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  26.59 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.38 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  29.33 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  23.99 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.57 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.79 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  25.08 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.17 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.28 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  23.53 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.55 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.46 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  24.84 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  23.28 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  20.87 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.1 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  22.79 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  21.97 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  23.32 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  23.81 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  23.57 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  23.77 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.52 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.18 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  24.24 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  22.89 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  24.12 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  23.14 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  22.85 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1447  Sporulation domain protein  21.01 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  21.55 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1161  hypothetical protein  26.56 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.245215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>