62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01030 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  648    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  49.83 
 
 
310 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  47.46 
 
 
314 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  45.87 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  46.08 
 
 
295 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  48.28 
 
 
305 aa  279  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  44.26 
 
 
303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  39.6 
 
 
303 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  35.97 
 
 
308 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  38.44 
 
 
310 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  35.37 
 
 
308 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  28.92 
 
 
345 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  28.66 
 
 
343 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  32.04 
 
 
331 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  30.91 
 
 
322 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  29.81 
 
 
323 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  33.66 
 
 
328 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  29.77 
 
 
327 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30.23 
 
 
322 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  29.72 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  27.27 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  27.17 
 
 
336 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  29.65 
 
 
331 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  31.29 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  29.47 
 
 
325 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.33 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  29.55 
 
 
310 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.57 
 
 
309 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  27.15 
 
 
304 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.45 
 
 
292 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.45 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  25.44 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.55 
 
 
348 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  27.89 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.53 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  25.5 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.66 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  28.09 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.25 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.35 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  27.5 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  28.01 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.31 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.76 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.57 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25.46 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  24.14 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.48 
 
 
348 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  25.84 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  22.46 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  25.4 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.51 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  23.9 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.54 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  22.59 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  21.53 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.24 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  21.68 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>