50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1690 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  58.02 
 
 
346 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  44.44 
 
 
350 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  44.97 
 
 
336 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  45.99 
 
 
349 aa  288  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  41.86 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  43.45 
 
 
343 aa  265  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  42.12 
 
 
343 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  40.31 
 
 
360 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  31.56 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  29.19 
 
 
342 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  26.3 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  25.15 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  26.28 
 
 
327 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  25.66 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.46 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  24.71 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.04 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.17 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  27.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.5 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.44 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.07 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  25.15 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  25.07 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  27.44 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  26.19 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  25.66 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  26.18 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  25.39 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  24.77 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.23 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  25.43 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  25.43 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  25.29 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.94 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.83 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  22.81 
 
 
328 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  24.14 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  23.96 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  23.99 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  23.62 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  23.49 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  22.99 
 
 
339 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  22.03 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  23.15 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  24.16 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  29.57 
 
 
304 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  21.33 
 
 
343 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>