43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0241 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  30.79 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  29.52 
 
 
343 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  29.34 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  28.86 
 
 
360 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  28.44 
 
 
349 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  29.19 
 
 
342 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.59 
 
 
338 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  29.09 
 
 
350 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  31.78 
 
 
335 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  30.71 
 
 
335 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  27.03 
 
 
336 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  29.17 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  31.76 
 
 
337 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  29.27 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  27.25 
 
 
360 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  26.98 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  26.71 
 
 
337 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  28.49 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  22.84 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.75 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.01 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.72 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  29.53 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  28.28 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  23.15 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.16 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  24.39 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  22.83 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.38 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.07 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  21.97 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.17 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  22.95 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.81 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  27.42 
 
 
309 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  23.11 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>