62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3972 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  51.3 
 
 
310 aa  322  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  48.8 
 
 
295 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  50.16 
 
 
305 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  49.19 
 
 
303 aa  295  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  49.66 
 
 
314 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  45.87 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  46.6 
 
 
303 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  43.73 
 
 
308 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  42.72 
 
 
308 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  38.26 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  36.18 
 
 
324 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  32.7 
 
 
322 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  31.11 
 
 
327 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  31.4 
 
 
323 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30.91 
 
 
322 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  28.7 
 
 
331 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  30.37 
 
 
343 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  27.98 
 
 
336 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  32.54 
 
 
332 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  29.09 
 
 
328 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  29.15 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  30.03 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  29.17 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.02 
 
 
318 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.02 
 
 
318 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  26.33 
 
 
345 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  29.45 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  28.06 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  24.48 
 
 
336 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  27.43 
 
 
309 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  26.33 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.14 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  27.43 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25.76 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.57 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.67 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.27 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.4 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  26.53 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  27.44 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.47 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25.81 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.61 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25.5 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  25.67 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.07 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  23.53 
 
 
343 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.69 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.95 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  24.32 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  22.38 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  21.75 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  22.73 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  31.3 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  27.56 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  24.46 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  22.03 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  24.43 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>