58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1698 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  53.14 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  49.35 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  51.7 
 
 
295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  47.44 
 
 
314 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  46.6 
 
 
307 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  45.67 
 
 
310 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  39.6 
 
 
318 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  39.34 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  37.18 
 
 
308 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  34.29 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  33.23 
 
 
324 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  34.41 
 
 
332 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  29.66 
 
 
331 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30.37 
 
 
322 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  29.17 
 
 
336 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  29.56 
 
 
318 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  31.72 
 
 
331 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  29.56 
 
 
318 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  31.11 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  30.39 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  31.15 
 
 
303 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  30.62 
 
 
325 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.38 
 
 
343 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.73 
 
 
339 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  26.28 
 
 
336 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.99 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.49 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  27.38 
 
 
348 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  28.19 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  26.84 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  27.51 
 
 
304 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  26.24 
 
 
313 aa  86.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  25.87 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  27.95 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  22.95 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.25 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  23.58 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.29 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  27.14 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25.63 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  22.56 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.63 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  21.99 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  24.57 
 
 
350 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.1 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  23.66 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  25.44 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  24.4 
 
 
333 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.05 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  23.01 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  22.15 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>