65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13648 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  55.59 
 
 
303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  54.26 
 
 
305 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  54.05 
 
 
295 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  48.08 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  46.33 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  49.04 
 
 
307 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  46.98 
 
 
303 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  39.42 
 
 
308 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  38.41 
 
 
310 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  36.7 
 
 
324 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  37.26 
 
 
308 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  34.81 
 
 
328 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  30.7 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  33.96 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  30.19 
 
 
322 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  31.93 
 
 
322 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  32.8 
 
 
303 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  31.87 
 
 
331 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.56 
 
 
336 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.82 
 
 
332 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.61 
 
 
325 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  30.24 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  30.24 
 
 
318 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  29.23 
 
 
343 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  31.33 
 
 
331 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  27.67 
 
 
345 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.96 
 
 
339 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  30.07 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  26.55 
 
 
336 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  28.52 
 
 
313 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  31.56 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  28.29 
 
 
309 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  27.07 
 
 
310 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.49 
 
 
324 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  30.25 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  28.43 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  27.92 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  24.48 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.25 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.9 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  27.23 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25.68 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.18 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.82 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.64 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  23.84 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  23.4 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.69 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  29.47 
 
 
343 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  24.79 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.53 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.86 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.04 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  26.23 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.62 
 
 
333 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.71 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  21.59 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  25.76 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  27.62 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25.11 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  24.46 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  28.38 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>