61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04500 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  44.51 
 
 
308 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  38.17 
 
 
324 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  38.26 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  39.74 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  38.96 
 
 
310 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  38.44 
 
 
318 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  38.05 
 
 
314 aa  195  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  35.74 
 
 
305 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  36.54 
 
 
295 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  36.42 
 
 
303 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  34.29 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  32.51 
 
 
322 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  32.3 
 
 
325 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  32.34 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  28.66 
 
 
343 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  32.73 
 
 
328 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.7 
 
 
336 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  31.92 
 
 
318 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  31.92 
 
 
318 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  29.46 
 
 
331 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.66 
 
 
322 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  30.91 
 
 
331 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  29.73 
 
 
339 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.63 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  26.57 
 
 
336 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  31.37 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.87 
 
 
327 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  28.25 
 
 
310 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.46 
 
 
309 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.22 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  26.44 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  27.08 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  27.72 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.43 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.73 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  28.12 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  26.35 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.43 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  26.71 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  25.77 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.07 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25.16 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  26.44 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  26.94 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  27.75 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  25.59 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.11 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.17 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  24.16 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  22.13 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.53 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25.65 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  24.55 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  29.37 
 
 
337 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  23.6 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  23.15 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  23.98 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>