48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0978 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  52.34 
 
 
316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  31.85 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  31.4 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.95 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  27.22 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.72 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  25.87 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.54 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  23.6 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  26.65 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  26.73 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.91 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  28.16 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  27.5 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  23.99 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  26.07 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  24.52 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.27 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  26.47 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.87 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.42 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26.82 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  24.55 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  24.25 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.1 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.13 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  23.85 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  27.83 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.22 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  25.38 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.05 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.69 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  21.74 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.55 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  21.88 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  22.64 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  24.41 
 
 
314 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.88 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.4 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  34.65 
 
 
313 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  21.36 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.49 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  21.54 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.06 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.25 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.71 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>