61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3688 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  56.89 
 
 
343 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  42.44 
 
 
338 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  40.7 
 
 
336 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  41.35 
 
 
342 aa  262  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  43.75 
 
 
346 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  40.12 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  40.46 
 
 
349 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  36.7 
 
 
360 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  28.29 
 
 
333 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  30.79 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  29.2 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  30.42 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  29.86 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  29.05 
 
 
335 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  28.53 
 
 
338 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  26.72 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  28.92 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  27.43 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.11 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  26.83 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.66 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.27 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.35 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.43 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.04 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  24.01 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.67 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.73 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  25.51 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.73 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  24.93 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  25.36 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.77 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  24.93 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  26.11 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.65 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  25.62 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  26.32 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  24.52 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  24.64 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  25.21 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  24.06 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  24.18 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  23.39 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.85 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  24.92 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  22.35 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  28.39 
 
 
295 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.65 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  21.81 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.23 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  26.51 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  29.37 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.59 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  27.87 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.17 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>