54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0548 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  49.85 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  51.17 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  48.62 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  32.66 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  31.19 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  30.22 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  28.79 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  27.99 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  27.42 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  30.68 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  32.52 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  28.69 
 
 		 343 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.76 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  27.57 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  27.84 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  27.17 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  27 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  28.45 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.71 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  27.48 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  33.94 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.14 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.99 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.66 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26.23 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25.75 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  27.19 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.92 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.84 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  25.88 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  24 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.24 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  31.25 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  24.44 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.59 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  28.48 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.28 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.86 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  30.2 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  23.8 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  29.19 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  23.28 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.17 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  22.13 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  21.57 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  23.89 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  29.37 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  22.41 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  27.06 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  26.15 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>