52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0287 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  28.33 
 
 
308 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  29.25 
 
 
324 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.57 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  27.12 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  28.72 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  29.43 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  27.14 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.02 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  26.84 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  26.5 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  24.59 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.71 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  26.09 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  24.39 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.8 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.07 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.07 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  24.74 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  24.52 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  22.56 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  25.88 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  25.88 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.25 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  23.53 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  23.66 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  22.94 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  24 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.74 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  25.88 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  22.11 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  22.5 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  20.13 
 
 
343 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  24 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  21.52 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.05 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  22.49 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  21.67 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  26.67 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  24.09 
 
 
306 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  24.72 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.3 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.16 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  22.81 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  21.41 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  22.86 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  21.17 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.24 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  21.57 
 
 
360 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>