59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3226 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  43.14 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  34.6 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  27.35 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  31.1 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  28.3 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  30.46 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.49 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  31.4 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.38 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.4 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  26.57 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  29.17 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  28.26 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.09 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  28.48 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  27.45 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  28.17 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.21 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.85 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  25.24 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  25.24 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  27.22 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  25.53 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  28.66 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  25.6 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  28.25 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.79 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  26.36 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.7 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.5 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  24.72 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  26.54 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.75 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.95 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.56 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  26.18 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.45 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.62 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.88 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.04 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  25.4 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25.97 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  24.7 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.39 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  24.1 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.81 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.52 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  25.86 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  23.28 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  24.1 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.25 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>