42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1986 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  29.21 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  31.23 
 
 
295 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  26.65 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  28 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  30.65 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  28.78 
 
 
323 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.6 
 
 
303 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  28.89 
 
 
331 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  27.82 
 
 
325 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.67 
 
 
327 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.1 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  29.33 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  26.12 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  25.87 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  24.83 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  24.92 
 
 
303 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  26.74 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  27 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  25.19 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.35 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.39 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  21.38 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  22.53 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  23.6 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.41 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  24.66 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  24.66 
 
 
318 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.9 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.39 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  21.72 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23.88 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  21.65 
 
 
316 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  20.13 
 
 
343 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  26.41 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.85 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  19.47 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.65 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  24.08 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.63 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>