57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1040 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  93.22 
 
 
295 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  94.6 
 
 
286 aa  541  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  41.03 
 
 
307 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  26.53 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  26.33 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.54 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  29.31 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  26.4 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  35.66 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  28.65 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  30.73 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.41 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  32.22 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  25.25 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  34.04 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  29.89 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  24.32 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  25.69 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  27.44 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  26.4 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  27.83 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.52 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.52 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  29.52 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  26.07 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  26.07 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  26.52 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  24.57 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.77 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  26.52 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  23.3 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  33.01 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  35.51 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  23.3 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  20.95 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  25.5 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  22.99 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  29.68 
 
 
335 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  28.48 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  28.39 
 
 
343 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  22.36 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  28.95 
 
 
360 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25.7 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.88 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  25.27 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.66 
 
 
335 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  25.7 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  31.07 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  32.94 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  30.64 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  26.23 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  24.21 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  21.85 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  29.58 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>