41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1797 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  706    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  31.41 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  31.42 
 
 
337 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  30.22 
 
 
337 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  27.3 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.89 
 
 
335 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  27.68 
 
 
336 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  27.03 
 
 
338 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  26.48 
 
 
360 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  27.53 
 
 
349 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  24.57 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.15 
 
 
342 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.05 
 
 
343 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  26.69 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  29.25 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  22.65 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.11 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  25.46 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  25.47 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.51 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.13 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  23.48 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.69 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25.7 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.1 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  22.51 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.48 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.33 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  23.05 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  30.51 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  24.43 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  23.98 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  23.68 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.05 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  30.32 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  22.61 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  31.07 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  23.41 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  21.81 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>