64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2199 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  64.72 
 
 
345 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  43.92 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  39.58 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  35.78 
 
 
318 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  35.48 
 
 
318 aa  222  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  35.33 
 
 
332 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  29.88 
 
 
310 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  28.35 
 
 
318 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  30.56 
 
 
295 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.61 
 
 
305 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  28.66 
 
 
310 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.59 
 
 
303 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  30.79 
 
 
308 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  30.37 
 
 
307 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30.46 
 
 
322 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  27.49 
 
 
314 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.63 
 
 
336 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  29.97 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.93 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  28 
 
 
324 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  25.44 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  25.68 
 
 
303 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.81 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  27.19 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  29.1 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  27.89 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.89 
 
 
331 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.83 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.74 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  25.72 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.41 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  22.71 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.57 
 
 
306 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.13 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  22.16 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  25.53 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.53 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.39 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.31 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.4 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  23.87 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.6 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  23.56 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  21.17 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  21.17 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  24.46 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  21.8 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  21.86 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  20.83 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  24.73 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.12 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  20.32 
 
 
313 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  23.39 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  20.13 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  22.77 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  20.37 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  22.04 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  21.95 
 
 
1588 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  20.94 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  21.05 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1447  Sporulation domain protein  19.03 
 
 
467 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  24.79 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  23.81 
 
 
341 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>