66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5273 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  65.43 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  59.37 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  50.32 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  44.34 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  42.34 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  41.75 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  34.04 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  38.72 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  35.2 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  31.91 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  33.64 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  32.32 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  32.17 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  34.41 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  30.91 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  30.37 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  31.53 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  30.23 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  31.36 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  30.21 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  29.24 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  28.66 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  27.98 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  29.07 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  27.5 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  28.1 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  28.66 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  26.01 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  26.3 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.35 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  28.11 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.21 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.36 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.07 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  26.49 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  34.75 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.51 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  26.23 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.68 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.19 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  35.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  34.04 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.86 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.3 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.68 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  22.43 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  24.78 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  26.06 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  27.5 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.01 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.7 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.56 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.71 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.11 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1588 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  26.58 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  28.47 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  30 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  22.54 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>