63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4539 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  76.95 
 
 
295 aa  488  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  75.17 
 
 
303 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  55.59 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  49.35 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  50.16 
 
 
307 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  48.5 
 
 
310 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  48.28 
 
 
318 aa  279  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  235  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  36.76 
 
 
324 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  35.74 
 
 
310 aa  192  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  39.46 
 
 
308 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  36.39 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  31.46 
 
 
322 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  33.12 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  33.12 
 
 
318 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  32.32 
 
 
322 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  31.41 
 
 
327 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  31.37 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  29.41 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.06 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  30.45 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.06 
 
 
336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  32.13 
 
 
328 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  26.96 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  27.1 
 
 
331 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  28.62 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  29.63 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  29.52 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  27.84 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.71 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  27.65 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  28.03 
 
 
304 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  28.4 
 
 
324 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  28.77 
 
 
313 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  24.48 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  29.45 
 
 
307 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.65 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  29.52 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25.72 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  24.68 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.76 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25.89 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  24.32 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.39 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  28.14 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.83 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.62 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  26.7 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  22.9 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  27.83 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.44 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  29.19 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  30.5 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  27.66 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.84 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  21.81 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  22.16 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>