40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1194 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  32.94 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  34.31 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  34.87 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  33.62 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  34.8 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  31.69 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  32.66 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  31.41 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  29.36 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  26.45 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  28.94 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  27.6 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  27.87 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.54 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  29.57 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.5 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.44 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.1 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  24.93 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.7 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  29.23 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.21 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.16 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.93 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.04 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  24.93 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  24.56 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  31.39 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.12 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.57 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.42 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.58 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.47 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.7 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  26.38 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  26.88 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  22.16 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  26.24 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  24.16 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>