41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3745 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  51.17 
 
 
337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  43.58 
 
 
335 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  33.62 
 
 
338 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  31.3 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  31.42 
 
 
348 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  29.23 
 
 
343 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  30.58 
 
 
343 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  26.18 
 
 
345 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  26.92 
 
 
360 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.91 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.66 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25.14 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  25.98 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  28.36 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  24.5 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  24.8 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  26.91 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  24.57 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  24.53 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  24.93 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  23.78 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  25.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.81 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.73 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.02 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  31.35 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.56 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.39 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.17 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  22.61 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  25.3 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.39 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  23.12 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  30.64 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  23.56 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  22.15 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  22.97 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  27.38 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>