64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1531 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  45.97 
 
 
336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  43.64 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  44.65 
 
 
343 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  35.38 
 
 
318 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  35.38 
 
 
318 aa  225  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.02 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  30.53 
 
 
336 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  30.37 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  27.64 
 
 
310 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  30.37 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  29.73 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.25 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  29.63 
 
 
308 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  28.99 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  27.57 
 
 
331 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  27.88 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  26.73 
 
 
303 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  25.38 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.98 
 
 
322 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  26.33 
 
 
318 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  26.71 
 
 
305 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  27.95 
 
 
328 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.83 
 
 
322 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  25.32 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.75 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  29.17 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  25.62 
 
 
306 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.14 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  27.97 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  26.69 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  22.85 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25.07 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.32 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.74 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  26.14 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  24.17 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  20.83 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  24.74 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.92 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25.44 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.65 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  20.18 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.14 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.22 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.24 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  25.42 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  24.29 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  22.99 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  23.88 
 
 
286 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  24.06 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  23.28 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.14 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  22.92 
 
 
338 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  22.99 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.85 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  20.8 
 
 
1588 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  26.88 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25.21 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  21.51 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  22.35 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>