54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3742 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  45.97 
 
 
339 aa  311  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  40.18 
 
 
343 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  37.08 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  34.23 
 
 
318 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  34.53 
 
 
318 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.82 
 
 
332 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  28.01 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  29.91 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.5 
 
 
336 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  29.63 
 
 
305 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  28.88 
 
 
308 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  27.44 
 
 
322 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  26.28 
 
 
303 aa  122  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  26.71 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.29 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  27.53 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.51 
 
 
331 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  27.53 
 
 
308 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  24.48 
 
 
307 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.5 
 
 
322 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  25.53 
 
 
324 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  25.07 
 
 
331 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.07 
 
 
328 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.38 
 
 
327 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  24.77 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  25.08 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  26.94 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  22.19 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  28.16 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  25.28 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  22.35 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  24.92 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25.24 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.91 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.75 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25.7 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  21.85 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.04 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  20.94 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  23.1 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  23.84 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23.3 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  24.92 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25.23 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.08 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  23.8 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  21.05 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  24.72 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>