52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5231 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  57.49 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  43.45 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  44.59 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  42.69 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  42.69 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  40.96 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  42.44 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  41.59 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  28.49 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  29.52 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  28.84 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  28.09 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  29.51 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  26.7 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  26.91 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  24.57 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  28.69 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.91 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.91 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  26.04 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  27.94 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.79 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  26.25 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  28.11 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.82 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.72 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  26.83 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  25.07 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.56 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.77 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  25.35 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  25.16 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.89 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.5 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  25.5 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  23.1 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  21.88 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  23.31 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  26.3 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  23.96 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  25.82 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  23.66 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  24.5 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  23.28 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  21.82 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  24.27 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  24.21 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.73 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>