55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2462 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  77.29 
 
 
336 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  44.35 
 
 
346 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  41.86 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  43.56 
 
 
343 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  42.09 
 
 
350 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  42.69 
 
 
343 aa  255  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  40.12 
 
 
349 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  38.46 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  27.03 
 
 
348 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  26.38 
 
 
333 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  26.59 
 
 
342 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.68 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  25.83 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  25.83 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.5 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  27.32 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.5 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.84 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.72 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  25.27 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.8 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.72 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  24.48 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.23 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  25.29 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  23.36 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  23.46 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  24.65 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.15 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  25.85 
 
 
360 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  23.58 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  24.93 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  27.75 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.7 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  23.71 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  24.1 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  23.1 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  23.78 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  22.89 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.55 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  23.08 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  23.44 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  23.74 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.15 
 
 
348 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  22.71 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.99 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  24.46 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  35.29 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  23.08 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  25.23 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.62 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  21.11 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.71 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  32.58 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>