60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3585 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  47.32 
 
 
308 aa  299  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  38.17 
 
 
310 aa  219  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  37.19 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  36.76 
 
 
305 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  36.3 
 
 
295 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  35.33 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  36.57 
 
 
314 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  36.18 
 
 
307 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  34.16 
 
 
310 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  32.8 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  34.63 
 
 
323 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  33.23 
 
 
303 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  35.09 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  35.2 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  32.11 
 
 
325 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  32.82 
 
 
331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  33.44 
 
 
303 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  32.8 
 
 
327 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  33.89 
 
 
331 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  32.7 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.07 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  29.8 
 
 
332 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  27.51 
 
 
343 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  27.84 
 
 
345 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  27.88 
 
 
339 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  28.12 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.46 
 
 
318 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  27.09 
 
 
304 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.46 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  31.4 
 
 
324 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.53 
 
 
336 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  27.27 
 
 
310 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  28.75 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.95 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  28.67 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  29.18 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.6 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.66 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  29.89 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.32 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.46 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  22.42 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  24.12 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  25.84 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  24.2 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.3 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  26.63 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.39 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  23.12 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  28.28 
 
 
342 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  24.47 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  30.2 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  23.49 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  22.71 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.88 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  20 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  21.87 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>