44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1033 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  656    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  52.34 
 
 
333 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  31.02 
 
 
329 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  31.69 
 
 
335 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  28.06 
 
 
332 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  26.18 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  25.72 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  23.99 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.28 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  24.1 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  28.01 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.17 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  25 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  23.33 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  24.3 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  23.64 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  24.14 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  23.58 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  24.92 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  22.43 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  26.71 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  24.85 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  28.37 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.49 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  25.81 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  22.42 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.44 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  22.91 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  24.58 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  23.1 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.52 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  23.81 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  24.69 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.92 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  26.09 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.81 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  22.34 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.48 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23.27 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  27.43 
 
 
1588 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25.15 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  21.67 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  26.88 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>