45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5862 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  41.94 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  41.76 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  41.03 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.73 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  30.71 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  27.83 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.08 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  29.45 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  28.09 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.74 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  28.8 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.48 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  26.97 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.32 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  28.84 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  27.21 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  27.44 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.28 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  24.83 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  36.59 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  24.49 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  28.37 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  27.72 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.14 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  31.05 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  26.07 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  26.06 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  39.78 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  26.43 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  24.2 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.37 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.6 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  29.75 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  27.87 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  24.12 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>