49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0529 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  30.03 
 
 
307 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  27.74 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  31.17 
 
 
322 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  30.2 
 
 
308 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  31.44 
 
 
303 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  29.43 
 
 
314 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  30.15 
 
 
295 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  27.3 
 
 
305 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  26.78 
 
 
303 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  26.25 
 
 
324 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.52 
 
 
318 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  27.03 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  27.15 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  26.17 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.14 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.39 
 
 
345 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.58 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  25.57 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  25.57 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  23.65 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  25.4 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  25.8 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.19 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  23.45 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  25.66 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.31 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.84 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.84 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.08 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  22.76 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  25.33 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  22.8 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  25.17 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.7 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  25.47 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.93 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.57 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25.58 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  28.01 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  29.23 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  25.45 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  26.41 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  21.2 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  29.92 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  21.13 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  31.67 
 
 
343 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>