66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2926 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  682    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  34.74 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  37.16 
 
 
308 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  35.31 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  34.41 
 
 
303 aa  159  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  34.41 
 
 
322 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  31.02 
 
 
339 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  31.82 
 
 
336 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  34.32 
 
 
303 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  32.15 
 
 
318 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  31.76 
 
 
310 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  32.08 
 
 
314 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  31.83 
 
 
318 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  32.54 
 
 
307 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  31.06 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  30.72 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  31.36 
 
 
295 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  30.32 
 
 
322 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  29.72 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  28.48 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  29.19 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  30 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  29.8 
 
 
324 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  30.16 
 
 
328 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  31.63 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  32.05 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  30.79 
 
 
308 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  28.3 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  31.73 
 
 
307 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  28.06 
 
 
316 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.35 
 
 
331 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  27.46 
 
 
303 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  28.16 
 
 
295 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  27.36 
 
 
304 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.95 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  27.65 
 
 
310 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  29.74 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.07 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  26.91 
 
 
292 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.93 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  28.04 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  25.51 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.54 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.42 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  26.32 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  25.47 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  27.48 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.15 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.48 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.23 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.84 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.23 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.56 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  26.17 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.47 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.53 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  24.12 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  26.13 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  24.22 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  24.56 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  22.81 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  27.64 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  22.15 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>