49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1559 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  726    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  74.57 
 
 
349 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  44.44 
 
 
342 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  47.95 
 
 
346 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  42.09 
 
 
338 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  40.42 
 
 
336 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  41.16 
 
 
343 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  41.59 
 
 
343 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  38.72 
 
 
360 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.15 
 
 
333 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  27.52 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  27.73 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  27.33 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  24.4 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.36 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  22.65 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  26.37 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26.76 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.76 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  24.93 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  23.1 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  24.4 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.17 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  25.75 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  27.83 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  29.45 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  26.63 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.18 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.46 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.08 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  22.19 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  21.39 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  24.57 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.14 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  24.47 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  25.65 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  30.65 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  24.39 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  31.3 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  29.07 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  26.83 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  29.9 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  29.07 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>