27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6900 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  38.46 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  32.94 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  29.55 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  29.6 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  29.7 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  27.99 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  26.18 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  28.84 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  32.23 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  25.36 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  27.84 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  27.33 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25.46 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  23.9 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  23.65 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  22.19 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25.5 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  22.41 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.74 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  22.81 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  22.09 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.36 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  23.96 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.23 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  22.54 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>