33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2605 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  708    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  28.66 
 
 
335 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  29.23 
 
 
337 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  28.44 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  28.79 
 
 
337 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.45 
 
 
338 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  26.24 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  25.36 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  24.71 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.85 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.14 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  23.65 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25.07 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  22.84 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  23.46 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.46 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  25.46 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  32.06 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  23.2 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  24.86 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  21.39 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  33.57 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  27.53 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25.9 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  23.53 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  27.66 
 
 
305 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  30.69 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  26.87 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  24.43 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  23.91 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>