52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0170 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  34.6 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  32.33 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.78 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  29.94 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  28.53 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  27.84 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.18 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.38 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  27.99 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  25.57 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.79 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  26.19 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  26.07 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  27.43 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  28.75 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26.81 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.81 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  28.83 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  26.25 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  26.93 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.07 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  33.52 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  23.1 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.55 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.14 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  25.43 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.46 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  25.53 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.35 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  24.84 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  22.35 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.66 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.75 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  24.24 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25.89 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  23.19 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.51 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  24.49 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25.14 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.95 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  24.23 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  25.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.15 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  29.75 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  23.53 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  22.13 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  25.66 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  22.97 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>