61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2592 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  46.36 
 
 
331 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  41.25 
 
 
336 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  40.27 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  39.33 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  37.9 
 
 
325 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  40.57 
 
 
327 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  34.04 
 
 
322 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  33.13 
 
 
308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  31 
 
 
310 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  32.82 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  29.66 
 
 
303 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  32.04 
 
 
318 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  28.7 
 
 
307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  31.02 
 
 
322 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  29.94 
 
 
303 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  29.46 
 
 
310 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  30.45 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  32.3 
 
 
314 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  29.27 
 
 
345 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  31.83 
 
 
303 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  27.2 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  27.09 
 
 
343 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  26.51 
 
 
336 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  27.41 
 
 
308 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  27.8 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.09 
 
 
324 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.35 
 
 
332 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.52 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  29.88 
 
 
304 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  23.9 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  28.4 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.72 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  27.92 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.13 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  22.1 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  25.25 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.76 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  26.92 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  25.99 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  23.1 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  27.44 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  24.23 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.85 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  23.65 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  26.42 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.69 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  23.94 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  26.33 
 
 
360 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  24.72 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  24.5 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.58 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  26.17 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  37.37 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  24.86 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  22.09 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  30.69 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>