56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1671 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  738    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  41.09 
 
 
346 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  40.18 
 
 
342 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  42.44 
 
 
343 aa  245  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  39.18 
 
 
336 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  38.03 
 
 
349 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  38.03 
 
 
350 aa  228  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  38.19 
 
 
338 aa  225  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  36.7 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  26.89 
 
 
333 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  29.13 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  26.33 
 
 
348 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  27.53 
 
 
341 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  27.25 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  27.78 
 
 
335 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  25.93 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.73 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.97 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26.97 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.77 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  25.46 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  26.14 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  28.36 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.81 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.75 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  24.14 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  24.76 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.63 
 
 
295 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.77 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.05 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  22.54 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  24.19 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  23.58 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  26.92 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  27.08 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  22.76 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  24.49 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  24.61 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  26.01 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.59 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  23.42 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.35 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  21.93 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.4 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  23.64 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  25.79 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  22.46 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  26.93 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  23.53 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.52 
 
 
345 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  24.75 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  23.1 
 
 
322 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  28.95 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  26.98 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  22.7 
 
 
303 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>