63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5753 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  50.32 
 
 		 322 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  47.56 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  44.27 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  41.5 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  39.88 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  37.9 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  41.95 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  36.92 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  32.3 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  31.37 
 
 		 305 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  31.63 
 
 		 310 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  29.97 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.43 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  30.22 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  30.62 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  32 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  29.15 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  29.91 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  29.91 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  29.34 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  32.05 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  28.31 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  28.29 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  29.47 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  27.35 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  28.53 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  28.29 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  30.35 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  28.66 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.75 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.48 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  28.23 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  28.72 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  27.94 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  35.66 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  22.79 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25.47 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.95 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  26.23 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  24.46 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  26.61 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  23.23 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  36.59 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.06 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  29.23 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  25.21 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  24.5 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.58 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  23.05 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  23.87 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  25.15 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  28.18 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  25.28 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  25.75 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  26.15 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>