62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3655 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  99.69 
 
 
318 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  35.78 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  35.09 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  33.72 
 
 
345 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  34.53 
 
 
336 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  33.12 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  33.75 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  30.86 
 
 
308 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  29.72 
 
 
310 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  29.56 
 
 
303 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.83 
 
 
332 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  31.92 
 
 
310 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  30.89 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  29.91 
 
 
325 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.6 
 
 
322 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  27.93 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  28.7 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  30.72 
 
 
328 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  27.38 
 
 
327 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  29.32 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  27.02 
 
 
307 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  28.34 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  27 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  27.46 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  25.9 
 
 
331 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.24 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  26.81 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  27.91 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  25.57 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  25.83 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  27.86 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  26.15 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.65 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.48 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  26.75 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  26.76 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  24.55 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.32 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  24.83 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  23.64 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  25.43 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.49 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.93 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.43 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.75 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  23.84 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  23.3 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.31 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  24.78 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  22.32 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  28.39 
 
 
342 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  22.7 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  26 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  26.82 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1447  Sporulation domain protein  23.12 
 
 
467 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>